Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms