Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLIRPQ9GZT3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLIRPQ9GZT3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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