Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms