Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN1Q9BY11 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms