Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms