Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms