Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL3Q9BXA9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms