Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms