Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms