Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGLYRP2Q96PD5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms