Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GPR78Q96P69 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms