Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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