Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms