Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms