Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms