Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms