Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHMTQ93088 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms