Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RABGGTAQ92696 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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