Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113Q902F9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms