Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ6

GEMIN5, Gem-associated protein 5, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN5Q8TEQ6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.278e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 MYH10-204ENST00000411957 732 ntTSL 329.14■■■□□ 2.258e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.258e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.228e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.189e-14■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 SERPINH1-204ENST00000525611 974 ntTSL 528.43■■■□□ 2.148e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 SERPINH1-207ENST00000526397 882 ntTSL 528.43■■■□□ 2.148e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.118e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 RHOC-217ENST00000527563 579 ntTSL 328.18■■■□□ 2.18e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF11-233ENST00000560901 603 ntTSL 327.97■■■□□ 2.078e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 931 ntTSL 1 (best)27.81■■■□□ 2.048e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 SLC11A2-211ENST00000547579 581 ntTSL 527.8■■■□□ 2.049e-14■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.018e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.958e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.928e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.928e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 OSBPL2-209ENST00000620616 2099 ntTSL 526.85■■□□□ 1.898e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 RAE1-208ENST00000492498 1156 ntTSL 526.79■■□□□ 1.888e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF11-221ENST00000559382 549 ntTSL 526.7■■□□□ 1.868e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF11-232ENST00000560713 543 ntTSL 426.7■■□□□ 1.868e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 JMJD1C-211ENST00000633035 499 ntTSL 326.55■■□□□ 1.848e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.838e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 MICAL3-215ENST00000578984 569 ntTSL 326.44■■□□□ 1.828e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.88e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF11-216ENST00000559017 849 ntTSL 526.16■■□□□ 1.788e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF11-235ENST00000561016 522 ntTSL 426.16■■□□□ 1.788e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF11-237ENST00000561056 577 ntTSL 426.16■■□□□ 1.788e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.758e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF11-226ENST00000559796 476 ntTSL 425.86■■□□□ 1.738e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF11-228ENST00000560171 590 ntTSL 325.86■■□□□ 1.738e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.78e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.78e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 PSRC1-212ENST00000492431 1870 ntTSL 1 (best)25.64■■□□□ 1.78e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 STXBP2-206ENST00000594221 747 ntTSL 325.49■■□□□ 1.678e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 PSRC1-207ENST00000418914 1040 ntTSL 1 (best)25.41■■□□□ 1.668e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.68e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 ERCC2-210ENST00000587376 817 ntTSL 525.02■■□□□ 1.68e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.68e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 RNASEK-206ENST00000552321 739 ntTSL 224.91■■□□□ 1.588e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 NR1D2-202ENST00000383773 3129 ntTSL 1 (best)24.51■■□□□ 1.518e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.478e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.468e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 GOLGA4-204ENST00000429018 2036 ntTSL 1 (best)24.13■■□□□ 1.458e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 PRPS2-201ENST00000380663 584 ntTSL 423.82■■□□□ 1.48e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.48e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF11-231ENST00000560614 547 ntTSL 423.79■■□□□ 1.48e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.48e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 NUP54-214ENST00000514307 566 ntTSL 423.68■■□□□ 1.388e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.378e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 MCM2-206ENST00000474964 2847 ntTSL 223.32■■□□□ 1.328e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 ERCC2-201ENST00000391941 2871 ntTSL 1 (best)23.3■■□□□ 1.328e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 MICAL3-212ENST00000498573 593 ntTSL 323.23■■□□□ 1.318e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 GOLGA4-205ENST00000431105 568 ntTSL 323.06■■□□□ 1.288e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF8-208ENST00000461888 2277 ntTSL 523.03■■□□□ 1.288e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 TPCN1-203ENST00000428632 2296 ntTSL 223.02■■□□□ 1.288e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 MCM2-204ENST00000472731 547 ntTSL 222.94■■□□□ 1.268e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF11-213ENST00000558638 581 ntTSL 422.93■■□□□ 1.268e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF11-220ENST00000559354 547 ntTSL 422.93■■□□□ 1.268e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.238e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF11-210ENST00000558215 581 ntTSL 422.7■■□□□ 1.228e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 GDI1-205ENST00000460984 552 ntTSL 222.11■■□□□ 1.138e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.138e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.18e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 SLC25A46-205ENST00000508781 558 ntTSL 421.95■■□□□ 1.18e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 E2F6-204ENST00000428221 3139 ntTSL 1 (best)21.83■■□□□ 1.098e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.078e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 CEP95-209ENST00000579860 895 ntTSL 521.7■■□□□ 1.068e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.058e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.038e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 SSR1-208ENST00000483409 570 ntTSL 421.46■■□□□ 1.038e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.029e-14■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF11-206ENST00000557809 568 ntTSL 421.39■■□□□ 1.028e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 FDFT1-219ENST00000531249 768 ntTSL 221.36■■□□□ 1.018e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 CEP95-210ENST00000580188 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 421.29■■□□□ 18e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF11-215ENST00000558914 2342 ntTSL 221.07■□□□□ 0.968e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 ATAD3B-205ENST00000485748 3233 ntTSL 221.06■□□□□ 0.968e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.958e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 ATAD3B-204ENST00000474481 3367 ntTSL 220.91■□□□□ 0.948e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.918e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.98e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 E2F6-206ENST00000444832 3296 ntTSL 1 (best)20.64■□□□□ 0.898e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.878e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.868e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.848e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF8-205ENST00000419626 439 ntTSL 220.27■□□□□ 0.848e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.838e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.839e-14■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.828e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.828e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.818e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.788e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 CACUL1-206ENST00000493518 3217 ntTSL 1 (best)19.89■□□□□ 0.778e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.768e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 RAE1-209ENST00000527947 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.718e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 BET1-201ENST00000222547 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.78e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF11-225ENST00000559593 575 ntTSL 419.27■□□□□ 0.688e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 GDI1-213ENST00000489589 918 ntTSL 219.14■□□□□ 0.658e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 BNIP3L-203ENST00000520077 922 ntTSL 1 (best)18.7■□□□□ 0.588e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 PIDD1-204ENST00000525028 3175 ntTSL 1 (best)18.59■□□□□ 0.578e-6■□□□□ 10.5
GEMIN5Q8TEQ6 DCAF11-203ENST00000396941 2402 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.568e-6■□□□□ 10.5
Retrieved 100 of 19,123 protein–RNA pairs in 96.5 ms