Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms