Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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