Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms