Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4T4

ARHGEF39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF39Q8N4T4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ARHGEF39Q8N4T4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ARHGEF39Q8N4T4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ARHGEF39Q8N4T4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ARHGEF39Q8N4T4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ARHGEF39Q8N4T4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ARHGEF39Q8N4T4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ARHGEF39Q8N4T4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ARHGEF39Q8N4T4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ARHGEF39Q8N4T4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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