Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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