Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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