Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYT9Q86SS6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms