Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTF1AQ7RTS3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTF1AQ7RTS3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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