Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms