Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HECW1Q76N89 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HECW1Q76N89 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms