Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC141Q6ZP82 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms