Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms