Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms