Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms