Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RTL6Q6ICC9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RTL6Q6ICC9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RTL6Q6ICC9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RTL6Q6ICC9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RTL6Q6ICC9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RTL6Q6ICC9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RTL6Q6ICC9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RTL6Q6ICC9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RTL6Q6ICC9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RTL6Q6ICC9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RTL6Q6ICC9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL6Q6ICC9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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