Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms