Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SAMD13Q5VXD3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SAMD13Q5VXD3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAMD13Q5VXD3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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