Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDSS1Q5T2R2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms