Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCAF6Q58WW2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms