Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms