Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C5orf22Q49AR2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf22Q49AR2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms