Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms