Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TWISTNBQ3B726 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms