Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL40Q2TBA0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms