Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPHKAPQ2M3C7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
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