Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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GEN1Q17RS7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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GEN1Q17RS7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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GEN1Q17RS7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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GEN1Q17RS7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GEN1Q17RS7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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