Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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