Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SGCAQ16586 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SGCAQ16586 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SGCAQ16586 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SGCAQ16586 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SGCAQ16586 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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SGCAQ16586 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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SGCAQ16586 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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SGCAQ16586 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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SGCAQ16586 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SGCAQ16586 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SGCAQ16586 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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