Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms