Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms